一)簡介:
用簡易的差分離心結(jié)合各種型式的密度梯度離心可以分離和純化各種亞細(xì)胞器。研究者也可以根據(jù)自己的設(shè)備情況對實驗 參數(shù)作一定的改動,也可以更多地利用速率--區(qū)帶密度梯度離心或等密度離心來簡化實驗過程和提高分離純度。
二)實驗:
勻漿制備:
鼠肝12克加入0.25M蔗糖與5mM Tris-HCL (PH7.4)共45ml用"概論"中建議的勻漿設(shè)備與方法制備成勻漿待用。
鼠肝勻漿的差分分離程序
該實驗流程中
沉Ⅰ:細(xì)胞核、質(zhì)膜大片斷,重線粒體,少量未破碎細(xì)胞及極少量沉Ⅱ→沉Ⅳ的成份
沉Ⅱ:重線粒體、質(zhì)膜片斷,及少量沉Ⅲ→沉Ⅳ成份。
沉Ⅲ:線粒體、溶酶體,高爾基膜,部分粗內(nèi)質(zhì)綱及極少量沉Ⅳ成份
沉Ⅳ:所有的細(xì)膜質(zhì)可溶部份。
離心Ⅰ:低速冷凍離心機,50ml管。離Ⅱ,離Ⅲ為高速冷凍離心機8×50ml角轉(zhuǎn)頭。
離Ⅳ為超速機或高速機8×50ml角轉(zhuǎn)頭。
ii)從沉Ⅱ中純化線粒體:
勻漿保持在200mM甘露醇,50mM蔗糖,1mM EDTA, 10mM Hepes-Naoh (PH7.4)中,全部操作均應(yīng)使勻漿在冰溶中,產(chǎn)生沉Ⅱ后去除上清表面以及離心管壁部的脂肪(這一點很重要)
加20ml保持液到沉Ⅱ中稀釋到30ml,3000g×10分再次離心并重復(fù)以上過程二次以上,最后的沉淀保持在10ML保持液中。
iii)從沉Ⅳ中部份純化光滑微粒體:
保持液為0.25M蔗糖,5mM Tris-Hcl (PH7.4)沉淀中光滑微粒體成松軟狀態(tài)位于緊密狀態(tài)的粗糙微粒體沉淀之上。
小心地倒掉上清Ⅳ后,在沉Ⅳ中加入2~3ml保持液,輕搖,大部份光滑微粒體(沉ⅣA)將分散到清液中,而沉Ⅳ(B)(粗糙微粒體,緊密沉淀)仍在沉降中,倒出沉Ⅳ(A),余下的沉Ⅳ B加入2~3ml保持液即完成。
iii)從沉Ⅰ中部份純化質(zhì)膜:
保持液用 1mM NaHCO3
鼠肝加25ml保持液在研缽中鍾擊15次,仍用1mMNaCHO3稀釋在100ml,攪拌2分鐘并用孔徑力75μm的尼龍布過濾。然后離心得到Ⅰ加5ml 1mM NaHCO3到沉Ⅰ中再放入勻漿器,慢速往復(fù)2~3次。再用1mM NaHCO3稀釋到15ml,用水平轉(zhuǎn)頭10ml玻璃錐形管,1200g離心10分鐘,不用制動減速到停車,沉淀很明顯由三層組成。輕輕搖動或攪動即可使最上層的線粒體溶入上清液。中間層富含質(zhì)膜,最下層是細(xì)胞核。倒去上清加5ml1mM NaHCO3輕搖使中間層進(jìn)入溶液,注意要盡可能少地擾動最下層核沉淀。將再次倒出的上清液稀釋到15ml并重復(fù)以上離心過程即可進(jìn)一步純化質(zhì)膜。
iv)從上Ⅲ中分離粗糙和光滑微粒體:
從已經(jīng)去掉線粒體的上Ⅲ中可以比從沉Ⅳ中更有效地分離粗糙及光滑微粒體,配置溶液
0.6M蔗糖,5mM Tris-HCL, (PH8.0)
15mM CSCL, 1.3M蔗糖,0.25M蔗糖
用角式轉(zhuǎn)頭,10~13ml厚壁PC(聚碳酸脂)離心管,先注入3ml 1.3M蔗糖-5mM Tris-HCL再注入1.5ml 0.6M蔗糖-5mM Tris-HCL從而形成了一個在離心管下部的階梯形密度梯度。在梯度上部注入上Ⅲ直至充滿離心管。100000g×90分鐘。離心后得到二個主要部份:在0.6M蔗糖界面處或稍下一點是光滑微粒體,沉淀是粗糙微粒體。
要針筒吸出光滑微粒體。沉淀用三倍空積的5mM Tris-HCL(PH8.0)稀釋后再次離心160000g×30分,得到粗糙微粒體沉淀,再用2-3ml的0.25M蔗糖與5mM Tris-HCL(PH8.0)稀釋即可。
V)從勻漿中純化細(xì)胞核:
配制溶液:0.25M蔗糖在TKM(0.05M Tris-HCL,PH7.5)中及2.3M蔗糖在TKM中,25mM KCL, 5mM Mgcl2
將鼠肝放在研缽中加0.25M蔗糖-TKM,沖研10~15二次,用紗布過濾后加入二倍容積的2.3M-TKM,這樣就使蔗糖的濃度為1.62M(該濃度最好用光折射儀檢測確認(rèn),20℃時折射率約為1.4115, 5℃時,1.4137)。
將此溶液9ml注入PC離心管,在溶液下屬注入3~4ml 2.3M蔗糖-TKM。 130000g×30分,5℃,甩平轉(zhuǎn)頭。
離心后倒去上清液即為核沉淀。它可以根據(jù)研究者需要用合適的緩沖劑稀釋。
vi)從沉Ⅰ中純化細(xì)胞核:
取沉Ⅰ,用旋渦混合器分散沉淀并加入等睇容積的60%(W/W)蔗糖--TKM,放入勻漿器上下抽動2~3次,繼續(xù)加入60%(W/W)蔗糖-TKM直至蔗糖濃度達(dá)到56%(W/W),用折射儀檢測(5℃折射率1.4356,20℃時,1.4328)。取該溶液9ml移入14ml聚碳酸脂(PC)離心管管下部鋪3~4ml60%(W/W)蔗糖液,在甩平轉(zhuǎn)頭中120000g 5℃離心30分鐘,倒去上清液。余下的核沉淀可用合適的緩沖液稀釋。為了消除沉淀中的膜,在制備勻漿時可用0.5% Triton x-100清洗。這種做法既消除了膜,又不影響核的結(jié)構(gòu)。
vii)從沉Ⅰ中純化質(zhì)膜
配制溶液:60%(W/W)蔗糖液,37.2%(w/w)蔗糖液均分別加在5mM Tris-HCL(PH8.0)中將已制備好的沉Ⅰ乘余的緩沖液一起用溫旋混合器混合后再加入60%(W/W)蔗糖使蔗糖終濃度為48%,并用折射儀檢測(5℃,1.4181; 20℃, 1.4158)。取以上溶液6ml注入14ml PC離心管,上鋪6ml 37.2%w/w蔗糖液以1m PH7.4緩沖液。在甩平轉(zhuǎn)頭中160000g, 5℃,離心3小時。
質(zhì)膜聚集在37.2%w/w蔗糖液的上部,用注射器吸出,并用三倍容積的5mM Tris-HCL(PH8.0)稀釋后再在100000g, 5℃離心40分鐘,沉淀即為質(zhì)膜。
viii)從沉淀Ⅰ中純化重體粒體
配制溶液:0.25M蔗糖,10mM Hepes-NaOH(PH7.5), 1mM EDTA, 1mM Mgcl2,2.4M蔗糖,將沉Ⅰ用0.25M蔗糖,10mM Hepes-Naoh (PH7.5),1mM Mgcl2稀釋到15ml。要盡可能避免動及沉淀最底部的紅色部份。將已稀釋部份倒出,混勻后加入23ml 2.4M蔗糖,10mMHepes-Na(OH)(PH7.5),1mM Mgcl2。所得到的最終蔗糖濃度力1.0M 。
用光折射儀測定(5℃,1.3827;20℃,1.3812)如需要,進(jìn)行調(diào)節(jié),將此液體倒入一個50ml PC管,上鋪8ml 0.25M蔗糖,10mM Hepes-Naoh(PH7.5)在35000g, 5℃離心10分鐘,倒去上清液重擦凈沾在離心管壁上的物質(zhì)。沉淀很清楚有二層,須離心管內(nèi)壁加入10ml 0.25M蔗糖10mM Hepes-Naoh (PH7.5), 1mM EDTA,輕輕晃動并稀釋沉淀的上部褐色重線粒體層。
對于其他組織材料的線粒體純化問題,請參照"Methods in Enzymology)第55卷。
?、某立笾屑兓苊阁w及粒體:
配制溶液:0.3M,1.1M,2.1M蔗糖分別溶入1mM EDTA與5mM Tris-HCL (PH7.0)在14mlPC管中制備好二個10ml,1.1M,2.1M蔗糖的線性梯度可以用梯度形成儀做成,也可以用不連續(xù)梯度(1.1M,1.4M,1.7M,2.1M,每種2.5ml)在5℃靜量12~16小時也會形成連續(xù)的1.1~2.1M近線性梯度。
在沉Ⅲ中加入10ml,0.3M蔗糖液,輕搖,慢慢地可以看到離心管底部沉積了暗褐色的沉淀(溶酶體)倒去上清,加入4ml 0.3M蔗糖液在勻漿器中磨勻(注意:活塞與器壁要松一些)。取2ml以上勻漿置于線性梯度(1.1M~2.1M蔗糖)之上,輕攪勻漿使其與梯度液之間的界面盡可能減少密度的不連續(xù),在甩平轉(zhuǎn)頭中95000g,5℃孫心4小時。
離心后,溶酶體區(qū)帶形成于1.20~1.26 g/cm3密度之間(在離心管下部)而線粒體則形成于1.17~1.21g/cm3密度之間(在離心管中部。溶酶體區(qū)帶中密度較高的部份相對較純。
用光折射儀測定(5℃,1.3827;20℃ 1.3812)如需要進(jìn)行調(diào)節(jié),將此液體例入一個50ml PC管,上鋪8ml 0.25M蔗糖,10mM Hepes-NaOH(PH7.5)在35000g,5℃離心10分鐘,倒去上清液重擦凈沾在離心管壁上的物質(zhì)。沉淀很清楚有二層,順離心管內(nèi)壁加入10ml 0.25M蔗糖10mM Hepes-NaOH (PH7.5) 1mM EDTA,輕輕晃動并稀釋沉淀的上部褐色重線粒體層。
對于其他組織材料的線粒體純化問題,請參照"Methods in Enzymology)第55卷。
Ⅸ)從沉Ⅲ中純化溶酶體及線粒體:
配制溶液:0.3M,1.1M,2.1M蔗糖分別溶入1Mm edta與5mM Tris-HCL(PH7.0)
在14ml PC管中制備好二個10ml, 1.1M,2.1M蔗糖的線性梯度可以用梯度形成儀做成,也可以用不連續(xù)梯度(1.1M,1.4M,1.7M,2.1M,每種2.5ml)在5℃靜置12~16小時也會形成連續(xù)的1.1~2.1M近線性梯度。
在沉Ⅲ中加入10ml,0.3M蔗糖液,輕搖,慢慢地可以看到離心管底部沉積了暗褐色的沉淀(溶酶體)倒去上清,加入4ml 0.3M蔗糖液在勻漿器中磨勻(注意:活塞與器壁要松一些)。取2ml以上勻漿置于線性梯度(1.1M~2.1M蔗糖)之上,輕攪勻漿使其與梯度液之間的界面盡可能減少密度的不連續(xù),在甩平轉(zhuǎn)頭中95000g,5℃離心4小時。
離心后,溶酶體區(qū)帶形成于1.20~1.26 g/cm3密度之間(在離心管下部)而線粒體則形成于1.17~1.21g/cm3密度之間(在離心管中部。溶酶體區(qū)帶中密度較高的部份相對較純。
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配置梯度溶液:38.79,36%,33%,29%(w/w)蔗糖液每種均加入5mM Tris-HCL(PH8.0)
用上清Ⅰ離心,10000g,5℃ 20分鐘待到沉Ⅱ+沉Ⅲ
用5ml 0.25M蔗糖,5mM Tris-HCL(PH8.0)稀釋沉淀,恒濕攪拌并使溶液的蔗糖濃度上升到43.07%(w/w),用光折射儀檢測(5℃,1.1979;20℃,1.1957)
在PC離心管中(13ml)由下往上依次鋪設(shè)如下層次:
3ml樣品(蔗糖濃度43%w/w),4ml 38.7%蔗糖液,2ml 36%蔗糖液,2ml 37%蔗糖液,2ml,29%蔗糖液。在甩平轉(zhuǎn)頭中160000g,5℃離心1小時,用注射器收集含有高爾基膜的上部二個區(qū)帶。
我們也可以用這個方法從全勻漿中來分離純化高爾基膜,勻漿中蔗糖濃度配到43.7%,然后用以上不連續(xù)梯度來分離純化,但是大于大容量勻漿,直接法是不合適的。
小結(jié):以上典型實驗(1)鼠肝勻漿為原料,以差分離心為主,輔以蔗糖的連續(xù)或不連續(xù)梯度分離各種亞細(xì)胞器,方法簡單易行,或本也較低。我們也可以用Ficoll,percoll, Metrizamide,Nycodenz,……等等梯度材料來分離純化亞細(xì)胞器。